Los Organismos del Sector Público de los Estados Partes, e instituciones mixtas o privadas establecidas en la reglamentación, intersados en recibir financiamiento del FOCEM, deberán presentar sus Proyectos a las Unidades Técnicas Nacionales FOCEM (UTNFs). Los documentos de los Proyectos deberán cumplir con los requisitos de formulación, análisis y presentación establecidos en el Reglamento FOCEM.

Aquellos Proyectos que cumplen los requisitos correspondientes y que el Estado Parte Beneficiario entiende de interés, son presentados por las UTNFs -a través de su Representación Permanente ante el MERCOSUR- a la Presidencia Pro Témpore de la Comisión de Representantes Permanentes del MERCOSUR (CRPM), para su análisis. La referida Comisión se expide sobre la elegibilidad de los Proyectos, y a partir de allí se cumple el siguiente proceso: